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pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)

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 UC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)所克隆的ORF1ab(168bp)含有中國(guó)疾控中心所公布的SARS-CoV-2冠狀病毒基因組中開(kāi)放讀碼框ORF1ab(open reading frame 1ab,ORF1ab)熒光檢測(cè)RT-PCR特異性引物(1ab-F: 5'-CCCTGTGGGTTTTACACTTAA-3';1ab-R: 5'-ACGATTGTGCATCAGCTGA-3',該對(duì)引物擴(kuò)增產(chǎn)生119bp片段)擴(kuò)增所包含區(qū)域,該克隆適用于SARS-CoV-2 的特異性檢測(cè)。

SARS-CoV-2 ORF1大約占整個(gè)基因組長(zhǎng)度的三分之二,位于病毒基因組5'端,編碼病毒復(fù)制酶,包括ORF1a和ORF1b。ORF1a和ORF1b分別編碼兩個(gè)多聚蛋白(poly-protein)即pp1a和pp1ab,多聚蛋白產(chǎn)生后,被病毒編碼的類(lèi)胰凝乳蛋白酶(chymotrypsin-like protease,3CLpro )或1-2個(gè)類(lèi)木瓜蛋白酶(papain-like protease,PLP)水解為具有獨(dú)立生物學(xué)功能的十六個(gè)非結(jié)構(gòu)蛋白(NSP1-NSP16),其中ORF1a 編碼 NSP1-NSP11,而ORF1b編碼NSP12-16。

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)質(zhì)粒的主要信息如下:

Feature Nucleotide Position
M13/pUC Forward Primer 378-395
ORF1ab 405-572
Multiple cloning site 573-594
M13/pUC Reverse Primer 608-625
Lac operator 633-649
Lac Promoter 657-687
ColE1 origin of replication(Ori) 1011-1599
Synthetic Beta-lactamase (Ampr) coding region 1770-2630

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)質(zhì)粒(2830bp)的圖譜如下:

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)的多克隆位點(diǎn)的詳細(xì)圖譜見(jiàn)

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)中沒(méi)有的酶切位點(diǎn)(Restriction enzymes that do not cut pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab (168bp))包括:

AflII

AccI AfeI AgeI AleI ApaI AscI
AsiSI AvrII BaeI BbsI BbvCI BfuAI BglII
BlpI BmgBI BmtI Bpu10I BsaAI BsaBI BseRI
BsgI BsiWI BsmFI BsmI BspDI BspEI BspMI
BsrGI BssHII BstBI BstEII BstXI BstZ17I Bsu36I
BtgI BtgZI ClaI CspCI DraIII EagI EcoNI
EcoRV FseI HincII HpaI MfeI MluI MscI
NaeI NcoI NgoMIV NheI NotI NruI NsiI
PacI PaeR7I PflFI PflMI PmeI PmlI PpuMI
PshAI PsiI PspOMI PspXI PstI RsrII SacII
SalI SbfI SexAI SfiI SgrAI SnaBI SpeI
SphI SrfI StuI StyI SwaI Tth111I XbaI
XcmI XhoI          

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)中的單酶切位點(diǎn)(Restriction enzymes that cut pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp))包括:

AatII G,ACGT`C 2761 EcoO109I RG`GNC,CY 2819
Acc65I G`GTAC,C 282 EcoRI G`AATT,C 594
AflIII A`CRYG,T 950 HindIII A`AGCT,T 399
AhdI GACNN,NN`NGTC 1842 KasI G`GCGC,C 235
AlwNI CAG,NNN`CTG 1363 KpnI G,GTAC`C 586
ApoI R`AATT,Y 594 NarI GG`CG,CC 236
AvaI C`YCGR,G 578 NdeI CA`TA,TG 184
BamHI G`GATC,C 573 NmeAIII GCCGAG(N)19,NN` 1900
BanII G,RGCYC 588 PciI A`CATG,T 950
BcgI ,NN`(N)10CGA(N)6TGC(N)10,NN` 2346 PluTI G,GCGC`C 235
BclI T`GATC,A 501 SacI G,AGCT`C 592
BpmI CTGGAG(N)14,NN` 1911 SapI GCTCTTCN`NNN, 834
BsaI GGTCTCN`NNNN, 1904 ScaI AGT|ACT 2323
BsaXI ,NNN`(N)9AC(N)5CTCC(N)7,NNN` 792 SfoI GGC|GCC 237
BseYI C`CCAG,C 1254 SmaI CCC|GGG 580
BsoBI C`YCGR,G 578 SspI AAT|ATT 2647
BspQI GCTCTTCN`NNN, 834 TspMI C`CCGG,G 578
BsrFI R`CCGG,Y 1923 XmaI C`CCGG,G 578
BstAPI GCAN,NNN`NTGC 182 XmnI GAANN|NNTTC 2442
Eco53kI GAG|CTC 590 ZraI GAC|GTC 2763

pUC18-SARS-CoV2-ORF1ab(168bp)質(zhì)粒中推薦使用的測(cè)序引物序列如下:

M13 fwd(378-395): 5'- TGTAAAACGACGG CCAGT -3'

M13 rev (608-625): 5'- CAGGAAACAGCTATGACC -3'

pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp)的全序列信息:D2953 pUC18-SARS-CoV2-ORF1ab(168bp)序列.txt。

包裝清單:

產(chǎn)品編號(hào) 產(chǎn)品名稱(chēng) 包裝
D2953-1μg pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp) 1μg
D2953-100μg pUC18-SARS-CoV-2-ORF1ab(168bp) 100μg
說(shuō)明書(shū) 1份

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-20℃保存。

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本質(zhì)粒未經(jīng)書(shū)面許可不得用于任何商業(yè)用途,也不得移交給訂貨人所在實(shí)驗(yàn)室外的任何個(gè)人或單位。

本產(chǎn)品僅限于專(zhuān)業(yè)人員的科學(xué)研究用,不得用于臨床診斷或治療,不得用于食品或藥品,不得存放于普通住宅內(nèi)。

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