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人類嗜T淋巴細(xì)胞病毒1型探針法熒光定量RT-PCR試劑盒

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人類嗜T淋巴細(xì)胞病毒1型(HumanT-lymphotropicVirus1HTLV1)是一種感染后可導(dǎo)致血癌或其他轉(zhuǎn)移癌的RNA病毒,在體內(nèi)主要感染CD4+T淋巴細(xì)胞可引起成人T淋巴細(xì)胞白血病/淋巴瘤、HTLV相關(guān)脊髓。℉TLV-Iassociatedmyelopathy,HAM/熱帶痙攣性下肢癱,tropicalspasticparaparesisTSP)及色素層炎(uveitis),主要通過輸血、針頭、性行為、母子傳染。HTLV-I病毒是艾滋病毒(HIV-I)的遠(yuǎn)親,但HTLV-I和艾滋病的發(fā)生沒有任何關(guān)連。目前各捐血中心以酵素免疫法全面篩檢HTLV-I病毒。本產(chǎn)品就是以探針法熒光定量PCR技術(shù)為基礎(chǔ)開發(fā)的人類嗜T淋巴細(xì)胞病毒1型探針法熒光定量RT-PCR試劑盒,它具有下列特點(diǎn):

1.即開即用,用戶只需要提供樣品RNA模板。

2.引物和探針經(jīng)過優(yōu)化,分析靈敏性高。

3.提供陽性對照,便于區(qū)分假陰性樣品。

4.特異性高,引物是根據(jù)HTLV病毒1型高度保守區(qū)設(shè)計(jì),不會跟其他病毒的RNA發(fā)生交叉反應(yīng)。

5.可用于定性檢測,又可用于定量檢測。用于定量檢測時線性范圍至少為5個數(shù)量級。

6.本產(chǎn)品足夠50次 20μL體系的探針法熒光定量RT-PCR反應(yīng)。

成分

編號

五孔盒包裝

探針法qRT-PCR緩沖液

190504a

500μL白蓋

探針法qRT-PCR酶混合液

190504b

100μL紅蓋

熒光PCR專用模板稀釋液

180701

1mL(綠蓋

HTLV病毒1型探針法qRT-PCR

引物-探針混合液

15-87810yp

150μL棕色管)

HTLV病毒1型探針法qRT-PCR

陽性對照(1×10E7拷貝/μL)

87810pc

50μL黃蓋

使用手冊

15-87810sc

1份

本產(chǎn)品只能用于科研。

運(yùn)輸及保存低溫運(yùn)輸,-20℃保存,保存期限為12個月。

自備試劑樣品RNA,超純水。

使用方法

一、稀釋標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品(以10E1-10E6拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)。由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高,因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行,千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原,本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照,只提供無傳染性的DNA片段作為陽性對照。

1.  標(biāo)記6個離心管,分別為6,5,4,3,2,1。

2.用帶芯槍頭分別加入45μL熒光RT-PCR專用模板稀釋液,最好用帶芯槍頭,下同。

3.在6號管中加入5μL1×10E7拷貝/μL的陽性對照(試劑盒提供),充分震蕩1分鐘,得1×10E6拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。

4.換槍頭,在5號管中加入5μL1×10E6拷貝/μL的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E5拷貝/μL的 標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。

5.換槍頭,在4號管中加入5μL1×10E5拷貝/μL的陽性對照(上步稀釋所得),充分震蕩1分鐘,得1×10E4拷貝/μL的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。

6.重復(fù)上面的操作直到得到6個稀釋度的標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品。放冰上待用。二、樣品RNA的制備

7.如果有N個樣品,最好設(shè)置N+2個提取,多出的是PC(樣品制備陽性對照)和NC(樣品制備陰性對照)?梢匀£栃詫φ盏1000倍稀釋液10μL再加上一定量的水,使總體積與待提取樣品的規(guī)定體積一致,以此作為PC。另外用水作為NC。

8.用自選方法純化樣品的RNA,本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒RNA提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的柱式病毒RNAout或免提取核酸釋放劑。

三、Probe qRT-PCR反應(yīng)(20μL體系,在樣品制備室進(jìn)行)

9.如果做定量分析并且只做1次重復(fù),則標(biāo)記 N+9個 RT-PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于RT-PCR陰性對照(用水做模板),6個用于標(biāo)準(zhǔn)曲線。如果做定性分析并且只做1次重復(fù),則標(biāo)記N+4個 RT-PCR管,其中N+2個用于上步得到的N+2個樣品,1個用于RT-PCR陰性對照(用水做模板),1個用于 RT-PCR陽性對照(用第4號管的陽性對照稀釋液做模板)。下面只以定量分析為例描述操作步驟。

10.在標(biāo)記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對照,并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后最后加):

成分/每管

樣品管

N+2

RT-PCR

陰性對照

標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品管

1-6管)

探針法qRT-PCR緩沖液

10μL

10μL

10μL

探針法qRT-PCR酶混合液

2μL

2μL

2μL

HTLV病毒1型探針法qRT-

PCR引物-探針混合液

3μL

3μL

3μL

N+2個待測RNA樣本

5μL

不加

不加

自備超純水

不加

5μL

不加

6步所得標(biāo)準(zhǔn)曲線樣品稀釋液

1-6號)

 

不加

 

不加

5μL1號樣到

1號管,2號樣

2號管…)

11.蓋上蓋子后上機(jī),按下面參數(shù)進(jìn)行RT-PCR:

過程

溫度

時間

逆轉(zhuǎn)錄

50℃

20min

預(yù)變性

95℃

10min

RT-PCR反應(yīng)

45個循環(huán))

95℃

15sec

 

60℃

1min采集FAM通道的熒光信號

五、數(shù)據(jù)處理
12.如果把本試劑盒用于定量檢測,則以陽性對照濃度的log值為橫軸,以Ct值為縱軸,繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的Ct值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品RNA濃度的log值,再推算出其濃度。
13.如果把本試劑盒用于定性檢測,只判斷陽性或陰性,則陰性對照Ct必須大于或等于33。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長,有典型擴(kuò)增曲線,Ct值應(yīng)該小于或等于32。對待測樣品,如果其Ct大于或等于33則為陰性,如果小于或等于32則為陽性。如果在32-33之間,則重復(fù)一次。重復(fù)實(shí)驗(yàn)的Ct值如果大于或等于33則為陰性,如果小于33,則為陽性。

 

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